Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms