Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmpcaQ9DC61 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PmpcaQ9DC61 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PmpcaQ9DC61 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PmpcaQ9DC61 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmpcaQ9DC61 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmpcaQ9DC61 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmpcaQ9DC61 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmpcaQ9DC61 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmpcaQ9DC61 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmpcaQ9DC61 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmpcaQ9DC61 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms