Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Swt1Q9DBQ9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms