Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tysnd1Q9DBA6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tysnd1Q9DBA6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms