Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop5Q9DB28 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms