Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Asf1bQ9DAP7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms