Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc89Q9DA73 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms