Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem239Q9DA47 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem239Q9DA47 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem239Q9DA47 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem239Q9DA47 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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