Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp12Q9D9M2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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