Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cntd1Q9D995 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntd1Q9D995 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms