Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc52a3Q9D6X5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc52a3Q9D6X5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms