Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc94Q9D6J3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms