Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rtl8cQ9D6I0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl8cQ9D6I0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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