Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhox2aQ9D4Y3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox2aQ9D4Y3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms