Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc83Q9D4V3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms