Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
4930556J24RikQ9D4U7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930556J24RikQ9D4U7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms