Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D454 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D454 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D454 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D454 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D454 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D454 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D454 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms