Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933421I07RikQ9D420 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms