Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
4933428G20RikQ9D3X4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms