Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snx20Q9D2Y5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx20Q9D2Y5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms