Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms