Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbr1lQ9D1E5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms