Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan11Q9D1D1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan11Q9D1D1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms