Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms