Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Hddc3Q9D114 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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