Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shmt2Q9CZN7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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