Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp11Q9CZJ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Utp11Q9CZJ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms