Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bud23Q9CY21 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms