Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Utp23Q9CX11 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Utp23Q9CX11 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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