Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NubplQ9CWD8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms