Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fcf1Q9CTH6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcf1Q9CTH6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms