Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CR55 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CR55 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CR55 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CR55 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CR55 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CR55 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CR55 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CR55 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CR55 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CR55 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CR55 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CR55 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CR55 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CR55 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CR55 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CR55 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms