Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms