Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms