Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Rdm1Q9CQK3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Rdm1Q9CQK3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Rdm1Q9CQK3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdm1Q9CQK3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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