Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc5Q9CQA1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms