Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700129C05RikQ9CQ77 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700129C05RikQ9CQ77 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms