Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl17Q9CPR4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl17Q9CPR4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl17Q9CPR4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl17Q9CPR4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl17Q9CPR4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl17Q9CPR4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl17Q9CPR4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl17Q9CPR4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl17Q9CPR4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms