Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Bcl11bQ99PV8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11bQ99PV8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11bQ99PV8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11bQ99PV8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11bQ99PV8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11bQ99PV8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11bQ99PV8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11bQ99PV8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11bQ99PV8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11bQ99PV8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11bQ99PV8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms