Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim26Q99PN3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim26Q99PN3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms