Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NsmfQ99NF2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NsmfQ99NF2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms