Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rims1Q99NE5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rims1Q99NE5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms