Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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Brms1Q99N20 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brms1Q99N20 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Brms1Q99N20 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Brms1Q99N20 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Brms1Q99N20 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brms1Q99N20 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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