Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clint1Q99KN9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms