Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf11Q99JX1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf11Q99JX1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms