Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lims1Q99JW4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms