Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms