Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Def8Q99J78 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Def8Q99J78 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms