Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim11aQ99J19 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim11aQ99J19 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms