Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim7Q923T7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim7Q923T7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms